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微生物專題 | 值得收藏！16S和宏基因組送樣要求匯總

邁維代謝
2022.4.18

?前言

隨著高通量測序技術(shù)的快速發(fā)展，人們對微生物的認知也在逐漸深入。微生物測序在環(huán)境、醫(yī)學(xué)、農(nóng)業(yè)、工業(yè)等各領(lǐng)域都有廣泛應(yīng)用，樣本種類繁多，上到高山之巔的土壤，下到海洋深處的底泥，既能研究其對環(huán)境變化的影響，又可探究動物體內(nèi)生理代謝的奧秘。常用的微生物檢測手段主要是16S/ITS/18S擴增子測序和宏基因組測序，充足的樣本量是保證測序質(zhì)量的第一步。

微生物樣本類型多樣，主要包括：糞便、腸道內(nèi)容物、拭子、瘤胃液、發(fā)酵液、組織液、沖洗液、組織、血漿、鮮奶、酸奶、土壤、污泥、沉積物、腐殖質(zhì)、水體濾膜、空氣濾膜、食品表面拭子、食糜等。不同的樣本類型需要的樣本量有區(qū)別，同一樣本類型不同測序策略需要的樣本量也有差異。

16S/ITS/18S擴增子測序所需樣本量如下：

宏基因組測序所需樣本量如下：

注：

（1）以上送樣量為參考量，實際以提取結(jié)果為準；

（2）DNA樣本需客戶提供電泳圖；

（3）PCR產(chǎn)物要經(jīng)過純化（如膠回收純化），PCR產(chǎn)物需帶有雙端 Barcode序列，需客戶提供電泳圖；

（4）特殊樣品，請聯(lián)系公司技術(shù)人員協(xié)商送樣量。

總 結(jié)

合格的樣本是準確獲取樣本微生物組數(shù)據(jù)的保障，是實驗和項目順利完成的基礎(chǔ)。以上是邁維代謝根據(jù)已有項目經(jīng)驗制定的微生物組樣本要求，保障客戶項目的順利開展。

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